La Consejería en Salud Sexual y (no) reproductiva tiene su origen como propuesta en la ex Escuela de Trabajo Social (HCACETS N°108/13) y comienza a implementarse en el año 2015. La iniciativa surge con la intención de generar intervenciones vinculadas a la salud sexual integral del colectivo estudiantil, como así también, brindar asesoramiento e información sobre infecciones de transmisión sexual y orientaciones en situaciones de violencia de género.
Actualmente, la Consejería se encuentra inscripta como proyecto de extensión en el Instituto de Política, Sociedad e Intervención Social (Res. 6/22 IPSIS) de la FCS, sosteniendo algunas iniciativas (Jornadas de testeos, kermes, proyectos en el norte cordobés) en estrecha articulación con la Secretaría de Asuntos Estudiantiles (SAE) y la Secretaría de Extensión (SE) de la FCS.